Cdk5 wird sowohl in zyklischen als auch in nicht zyklischen Zellen exprimiert und ist in zahlreichen Geweben von Säugetieren vorhanden. Neuronale und Muskelzellen enthalten die größte Menge dieses Proteins. Das p35-Protein, das nur im Gehirn vorkommt, aktiviert Cdk5. Die Cdk5-Aktivität ist an der terminalen Differenzierung von Neuronen und Muskelzellen beteiligt.