Das caudal-related homeodomain protein2 (CDX2) ist ein Transkriptionsfaktor, der nachweislich eine Rolle bei der Entwicklung des Dünn- und Dickdarms bei Säugetieren und bei der Differenzierung von Darmepithelzellen spielt. Es hat sich gezeigt, dass der Nachweis von CDX2-Protein durch IHC mit der Höhe der RNA-Transkription korreliert. In Studien mit 745 Krebsarten aus vielen anatomischen Bereichen wiesen Adenokarzinome des Kolons in 90% der Fälle eine starke Färbung auf, während Adenokarzinome des Magens, der Speiseröhre und der Eierstöcke nur in 30% der Fälle eine starke Färbung zeigten. CDX2- und Villin-Färbungen sind nützliche Marker für die Differenzialdiagnose von Blasenadenokarzinomen und sekundären kolorektalen Adenokarzinomen.